Monografie:

• Hřích, zločin, šílenství v čase odkouzlování světa. Praha: Argo, 2004. 80-7203-565.
• Francouzská revoluce. Praha: Triton 2008
• Revoluční Francie 1787-1799. Triton: Praha, Kroměříž: Triton, 2008. 978-80-7387-211-3.
• Tělo, věda, stát. Zrození porodnice v osvícenské Evropě. Praha: Argo, 2010. 978-80-257-0223.
• Jakobíni v sutaně. Neklidní kněží, strach z revoluce a pozdní osvícenství na Moravě. Praha: Argo, 2011. 978-80-257-0441.
• Zákeřná mefitis. Zdravotní policie a veřejná hygiena v pozdně osvícenských Čechách. Praha: Argo, 2012. ISBN 978-80-257-0636-7.

Jako spoluautorka monografie:

• Pavel Bělina – Milan Hlavačka – Daniela Tinková: Velké dějiny zemí Koruny české, svazek XI.a (1792-1860), Paseka Praha-Litomyšl 2013, 466 stran, ISBN 978-80-7432-347-8, ISBN 80-7185-264-3 (soubor)

encyklopedie, slovníky:

• M. Hroch – L. Klusáková – K. Kubiš – D. Tinková – J. Tuček, Encyklopedie dějin novověku, 1492-1815, Libri, Praha 2005, ISBN 80-7277-246-5.
• Překlad a edice:
• Zrození občana. Antologie textů z Francouzské revoluce, ed. D. Tinková (překlady K. Jirsová-Jelínková, J. Růžička, D. Tinková, E. Tinková). Academia, Praha 2014, v tisku

Jako (spolu) editorka:

• TINKOVÁ Daniela, NODL Martin (edd.). Antropologické přístupy v historickém bádání. Praha: Argo, 2008. 978-80-7203-923.
• Claire Mádl – Daniela Tinková (eds.), Francouzský švindl svobody. Francouzská revoluce a veřejné mínění v českých zemích, Argo 2012, ISBN 978-80-257-0695-4
• Jaroslav Lorman – Daniela Tinková (eds.): Post tenebras spero lucem. Duchovní tvář českého osvícenství, Casablanca, Praha 2008, 415 str.
• Jaroslav Lorman – Daniela Tinková (eds.): Od barokní piety k interiorizaci víry? Problémy katolického osvícenství v českých zemích. Historie-otázky-problémy 1 (2/2009), Ústav českých dějin FFUK, ISSN: 1804-1132
• Vladan Hanulík – Milena Lenderová – Daniela Tinková (eds.): Dějiny těla. Prameny, koncepty, historiografie. Pavel Mervart, Červený Kostelec 2013, ISBN 978-80-7465-068-0

Nejdůležitější studie:

• „Dobrovolná smrt a elita Francouzské revoluce“, in Český časopis historický, 1/1997, str. 1-34
• „Suicide, His Body and His Soul in the Age of Reason“, in : Menschen, Strukturen, Handlungen, Václav Bůžek – Dana Štefanová (edd.), Opera Historica 9, České Budějovice 2001, str. 295-324
• „Profanace posvátna a odkouzlování světa. Rouhačství a svatokrádež mezi „magickým světem“ tradiční Evropy a na prahu občanské společnosti“, in Lidé města 12/2003, s. 13-49.
• “Ilegitimita a nová ekonomie života: svobodné matky a nemanželské děti mezi sociální péčí a kontrolou v osvícenském “Rakousku””, in: Historická demografie 27, Sociologický ústav AVČR, 2003, ISSN: 0323-0937, str. 133-172
• “”Ve jménu přirozenosti věcí” – genderové identity, “bio-moc” a osvícenská věda”, Práce z dějin vědy 6, Semináře a studie Výzkumného centra pro dějiny vědy z let 2002-2003, Praha 2003, str. 571-615
• „Revoluce a smysl dějin. Esej o mýtu revolučního zlomu a „logiky“ dějin v historiografické reflexi“, in Dějiny-teorie-kritika I., Praha 2004, str. 30-59
• „Čas nejistot“ a „kritický obrat“. K diskusím ve francouzské historiografii na sklonku 90. let, in Dějiny – teorie – kritika II., Praha 2004, s. 253-269.„Gironda mezi rudou a bílou I. Otázka „Republiky bez Teroru“ ve francouzské historiografii 19. století“, in Interpretace Francouzské revoluce, CDK Brno 2004, s. 40-54
• „Gironda mezi rudou a bílou II. Tváří v tvář „jakobínské vizi“ revoluce ve 20. století“, in Interpretace Francouzské revoluce, CDK Brno 2004, s. 105-116
• „Povera nostra Toscana“ a „francouzská uzurpace“. Z exilové korespondence arcivévody Ferdinanda a toskánského vyslance ve Francii, Luigi Angioliniho (1799-1803) v pražském Národním archivu, in Lukáš FASORA – Jiří HANUŠ – Jiří MALÍŘ, Napoleonské války a historická paměť (Země a kultura ve střední Evropě 1), Brno 2005, s. 125-145, ISBN 80-86488-32-3.
• Jazyk, symbol, revoluční moc. Ke sporům o „kulturní interpretaci“ Francouzské revoluce ve francouzské a anglosaské historiografii poslední čtvrtiny 20. století, in Kultura jako téma a problém dějepisectví, Tomáš Borovský – Jiří Hanuš – Milan Řepa (eds.), edice Země a kultura ve střední Evropě 2, Brno 2006, s. 71-89. „Člověk-stroj“ nebo „člověk citlivý“? K vitalistické fyziologii 18. století a myšlení Jiřího Prochasky, in Historia – Medicina – Cultura. Sborník prací Ústavu dějin lékařství, Karel ČERNÝ (ed.), 1. lékařská fakulta UK, Praha 2006, s. 107-131
• - „Biomoc a „politická anatomie lidského a společenského těla“. Foucaultův koncept biomoci ve vztahu k otázce modernizace státu, zrození humanitních věd a medikalizace společnosti na přelomu 18. a 19. století“ in Historie – teorie – antropologie, L. Storchová (ed.), FHS UK Praha 2006, s. 115-139
• „Historie jako aplikovaná psychologie. K pozitivismu a historickému skepticismu Hippolyta Taina a jeho ohlasu v českém postředí“, in Historik v proměnách doby a prostředí – 19. století, Jiří Hanuš – Radomír Vlček (eds.), Brno 2007, s. 57-83
• - s Janem Horským: Roger Chartier: Nové intelektuální a kulturní dějiny jako historiografická odpověď na výzvy postmoderních kritik, in Jiří HANUŚ – Radomír VLČEK (eds.), Historik v proměnách doby a prostředí – 20. století, Matice moravská, Historický ústav AVČR, v. v. i., Brno 2009, s. 27-56
• - Názory venkovského faráře aneb „Velká evropská revoluce ještě není završena“. „Correspondance littéraire“ Jana Ferdinanda Opize s Karlem Killarem, in Cornova. Revue České společnosti pro výzkum 18. století a FFUK, 1,1/2011, s. 81-96. ISSN 1804-6983.
• Kariéra prvních krajských lékařů a chirurgů v Čechách po josefínských reformách, Český časopis historický 109/2011, Číslo 3, s. 432-487.
• „Ohyzda na prodej“ a „zmatení pojmů“. Koncept svobody a rovnosti v protirevolučních brožurách z českých zemí (1793-1799) in Francouzský švindl svobody, C. Mádl – D. Tinková (eds.), Argo, Praha 2012, s. 101-142.

Zahraniční publikace:

MONOGRAFIE:

• Péché, crime, folie au temps du „désenchantement du monde“, EHESS, Paris 2013, 572 stran. (+ digitalizovaná podoba disertace veřejně přístupná na serveru doc-thèses: Péché, crime, folie au temps du „désenchantement du monde“, EHESS, Paris 2002, 572 stran.)

STUDIE:

• « Protéger ou punir? Les voies de la décriminalisation de l’infanticide en France et dans les domaines des Habsbourg (XVIIIe – XIXe siècles) », in Crime, History and Societies / Crime, Histoire et Sociétés 9/2. Droz, Genève 2005, s. 43-71.
• „L´apprivoisement idéologique et artistique du passé: le roman historique tchèque, 1945-1989“. In La littérature face à l‘histoire, Discours historique et fiction dans les littératures est-européenes, L Harmattan, Paris 2005, p. 185-199
• „Le champ de bataille d’Austerlitz. Deux siècles de mémoire vivante“ in Les lieux de mémoire en Europe centrale, Antoine MARES (ed.), INALCO – Université Paris I, 2009, s. 49-58.
• Tschechisch als Karrierevorteil? Die Professionaliserung der Geburtshilfe und das Problem des sprachlichen ‚Utraquismus‘ an der Wende des 18. zum 19. Jahrhundert, in Bohemia. Zeitschrift für Geschichte und Kultur der böhmischen Lander, 49 (2009) 1, Oldenbourg Verlag, München, s. 76–95, ISSN 0523-8587;
• „La (re)naissance de l’obstétricien(ne). Une nouvelle profession dans l´Europe des Lumieres? L´exemple de deux régions habsbourgeoises – a Toscane et la Boheme (1750-1820)“ in Saperi a confronto. Trasmissione dei saperi nell’Europa dal XIII al XIX secolo, Maria Pia PAOLI (ed.), Scuola Normale Superiore, Pisa, 2009, s. 395-412, ISBN 978-88-7642-350-5
• « La grande révolution de l’Europe n’est pas encore achevée». La Correspondance littéraire de deux « jacobins » francophones de province en Bohême. In Le rayonnement francais en Europe centrale du XVIIe siecle a nos jours. Centre d´Etudes des Mondes Moderne et Contemporain, ed. Olivier CHALINE – Jaroslaw Dumanowski – Michel FIGEAC, Bordeaux 2009, s. 386-406. ISBN : 2-85892-346-7 ; EAN/ISBN : 978-2-85892-346-9
• Une espérance révolutionnaire en Moravie. L´imaginaire politique et philosophique de trois curés francophiles (1790-1803), in Annales Historiques de la Révolution Francaise – 2012 – N° 4, s. 103-130
• Dass „Revolutionen in der politischen, und moralischen Welt so nothwendig seyen, wie Stürme und Ungewitter in Natur“. Sympathisanten der Französischen Revolution unter Geistlichen in Südmähren. In: Bohemia. Zeitschrift für Geschichte und Kultur der böhmischen Länder. R. Oldenbourg Verlag München, Band 52 (2012), Heft 2, 2012, s. 239-276, ISSN 0523-8587.
• La peste de la liberté. Les franҁais suspets de jacobinisme en Bohême et en Moravie (1790-1800), in La République en voyage (1770-1830), Gilles Bertrand – Pierre Serna (eds.), Presses Universitaires de Rennes 2013, s. 109-121.